La CIF remplit des missions récurrentes et ponctuelles d’analyse budgétaire, comptable et financière pour le Gouvernement wallon et le Gouvernement de la Fédération Wallonie-Bruxelles. Elle dispose d’une expertise en matière de partenariats public-privé. Elle conseille, accompagne, conçoit et met en œuvre des procédures et des outils de suivi.
Depuis 2014, la CIF est le point de contact unique de la Wallonie (le SPOC) à l’égard de l’Institut des Comptes Nationaux. Dans ce cadre, elle est l’interlocuteur privilégié des unités institutionnelles reprises dans le secteur des administrations publiques de la Wallonie au sens du SEC 2010.